6 сентября 2004 года, в день памяти святителя Петра, Митрополита Московского, Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II совершил Божественную литургию в Успенском соборе Московского Кремля.
5 сентября 2004 года, в День города Москвы, в зале Церковных Соборов Храма Христа Спасителя состоялось торжественное открытие Межрегионального фестиваля молодежи и студентов «Обретенное поколение».
В связи с захватом школы в Северной Осетии 1 сентября 2004 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II выступил с заявлением, в котором призвал всех россиян и весь мир к единству в отвержении террора и борьбе с ним.
Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II направил Мэру Москвы Ю.М. Лужкову телеграмму, в которой выразил соболезнование родным и близким жертв взрыва, прогремевшего 31 августа 2004 года возле станции метро «Рижская».
29 августа 2004 года, в попразднство Успения Пресвятой Богородицы, Святейший Патриарх Алексий совершил Божественную литургию и молебен в храме святителя Николая в Звонарях — московском подворье Успенского Пюхтицкого монастыря.
28 августа 2004 года, в праздник Успения Пресвятой Владычицы нашей Богородицы и Приснодевы Марии, Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II совершил Божественную литургию в Успенском соборе Московского Кремля.
Указом Его Святейшества Патриарший викарий архиепископ Истринский Арсений награжден орденом Святителя Иннокентия, Митрополита Московского и Коломенского (II степени).
В связи с трагедией, произошедшей в небе России вечером 24 августа 2004 года, Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II направил Президенту Российской Федерации В.В. Путину письмо соболезнования.
В связи с катастрофами самолетов Ту-154 и Ту-134, выполнявших рейсы из московского аэропорта «Домодедово» в Сочи и Волгоград, 25 августа 2004 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II направил телеграммы соболезнования митрополиту Екатеринодарскому и Кубанскому Исидору и митрополиту Волгоградскому и Камышинскому Герману.
18 августа 2004 года под председательством Полномочного представителя Президента Российской Федерации в Центральном федеральном округе Г.С. Полтавченко прошло совещание по вопросам возвращения исторических колоколов московского Данилова монастыря из Гарвардского университета (США).
