30 ноября 2021 года на основании решения Совета учредителей Российского православного университета святого Иоанна Богослова от 10 ноября 2021 года Патриарший наместник Московской митрополии митрополит Крутицкий и Коломенский Павел официально вступил в должность ректора учебного заведения.
Ректором РПУ владыка Павел был назначен указом Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла от 21 октября 2021 года.
